본원 임원진은 제1기(2004~2007년) 김세곤 이사장, 이종욱 원장, 제2기(2007~2010년) 김성덕 이사장, 이무상 원장, 제3기(2010~2013년), 제4기(2013~2016년) 이윤성 이사장, 안덕선 원장이 역임했고 제5기 원장은 2016년 2월25일 제17차 이사회에서 김영창 원장을 선임한 바 있다.
김봉옥 이사장은 현재 대한의사협회 부회장, 대한병원협회 국제이사, 한국여자의사회 부회장 등 의료계 주요 분야에서 활발한 활동을 수행하고 있다.
특히 다양한 국제업무 경험이 있어 이를 토대로 의학교육 평가인증 제도의 국제화 및 우리나라 의학교육의 국제적 위상을 드높이는 데 큰 역할을 수행할 것으로 기대된다.
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